HARIBOSS - RNA-SM complexes list

4x4v

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Crystal structure of the A.fulgidus CCA-adding enzyme in complex with a human MenBeta minihelix ending in CCACC and AMPcPP

SM: 5GP 5GP 5GP APC APC

4ybb

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High-resolution structure of the Escherichia coli ribosome

SM: 1PE 1PE PG4 PG4 PG4 PG4 PG4

5dhc

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Cooperativity and Downstream Binding in RNA Replication

SM: 5GP 5GP 5GP 5GP 5GP 5GP 5GP 5GP

5hbx

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RNA primer-template complex with 2-methylimidazole-activated monomer analogue-2 binding sites

SM: PZG PZG PZG PZG PZG PZG PZG PZG

5hby

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RNA primer-template complex with 2-methylimidazole-activated monomer analogue-3 binding sites

SM: PZG PZG

5hkv

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The crystal structure of the large ribosomal subunit of Staphylococcus aureus in complex with lincomycin

SM: 3QB

5it8

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High-resolution structure of the Escherichia coli ribosome

SM: 1PE 1PE PG4 PG4 PG4 PG4 PG4

5j5b

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Structure of the WT E coli ribosome bound to tetracycline

SM: 1PE 1PE PG4 PG4 PG4 PG4 PG4 TAC TAC

5j7l

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Structure of the 70S E coli ribosome with the U1052G mutation in the 16S rRNA bound to tetracycline

SM: 1PE 1PE PG4 PG4 PG4 PG4 PG4 TAC TAC TAC TAC

5j88

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Structure of the E coli 70S ribosome with the U1060A mutation in 16S rRNA

SM: 1PE 1PE PG4 PG4 PG4 PG4 PG4

5j8a

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Structure of the E coli 70S ribosome with the U1052G mutation in 16S rRNA bound to tigecycline

SM: 1PE 1PE PG4 PG4 PG4 PG4 PG4 T1C T1C

5j91

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Structure of the Wild-type 70S E coli ribosome bound to Tigecycline

SM: 1PE 1PE PG4 PG4 PG4 PG4 PG4 T1C T1C

5jc9

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Structure of the Escherichia coli ribosome with the U1052G mutation in the 16S rRNA

SM: 1PE 1PE PG4 PG4 PG4 PG4 PG4

5ndg

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Crystal structure of geneticin (G418) bound to the yeast 80S ribosome

SM: GET GET GET GET GET GET GET GET GET GET GET GET GET GET GET GET GET GET GET GET GET

5ndv

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Crystal structure of Paromomycin bound to the yeast 80S ribosome

SM: PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR

5obm

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Crystal structure of Gentamicin bound to the yeast 80S ribosome

SM: LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL LLL

5tgm

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Crystal structure of the S.cerevisiae 80S ribosome in complex with the A-site bound aminoacyl-tRNA analog ACCA-Pro

SM: PHE PHE SPS SPS

5v0j

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RNA duplex with 2-MeImpG analogue bound-2 binding sites

SM: 8OS 8OS 8OS 8OS

5v0k

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RNA duplex with 2-MeImpG analogue bound-3 binding sites

SM: 8OS 8OS

5vj9

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Guanidine-II riboswitch P2 hairpin dimer from Pseudomonas aeruginosa

SM: SPM SPM SPM SPM SPM

5vjb

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Guanidine-II riboswitch P2 hairpin dimer with 5-bromoU substitution from Pseudomonas aeruginosa

SM: SPM SPM SPM SPM

6az3

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Cryo-EM structure of of the large subunit of Leishmania ribosome bound to paromomycin

SM: PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR PAR

6c8d

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RNA-dGMP complex with Mg ion

SM: DGP DGP DGP DGP

6c8i

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RNA-activated 2-AIpG monomer complex, 5 min soaking

SM: EQ4 EQ4 EQ4 EQ4

6c8j

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RNA-activated 2-AIpG monomer complex, 15 min soaking

SM: EQ4 EQ4 EQ4 EQ4

6cab

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RNA-dGMP complex with Sr ion

SM: 5GP 5GP 5GP 5GP

6e1t

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Crystal structure of a class I PreQ1 riboswitch complexed with a synthetic compound 1: 2-[(dibenzo[b,d]furan-2-yl)oxy]ethan-1-amine

SM: HLV MES

6e8s

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Structure of the iMango-III aptamer bound to TO1-Biotin

SM: EKJ EKJ SPM

6i1l

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Crystal structure of FnCas12a in complex with a crRNA guide and ssDNA target

SM: CIT CIT CIT CIT CIT CIT

6izp

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Solution structure of the complex of naphthyridine carbamate dimer and an RNA with UGGAA-UGGAA pentad

SM: B2R B2R

6jjh

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Crystal structure of a two-quartet RNA parallel G-quadruplex complexed with the porphyrin TMPyP4

SM: POH POH

6p1u

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Post-catalytic nicked complex of human DNA Polymerase Mu with 1-nt gapped substrate containing template 8OG and newly incorporated CMP

SM: CTP

6qiq

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Crystal structure of seleno-derivative CAG repeats with synthetic CMBL3a compound

SM: J48 J48

6qir

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Crystal structure of CAG repeats with synthetic CMBL3a compound (model I)

SM: J48 J48 J48 J48

6qit

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Crystal structure of CAG repeats with synthetic CMBL3b compound

SM: J48 J48 J48 J48

6tnu

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Yeast 80S ribosome in complex with eIF5A and decoding A-site and P-site tRNAs.

SM: 3HE

6uu3

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E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 4-nt RNA and a CTP ("Old" crystal soaked with GTP, ATP, CTP, and ddTTP for 30 minutes)

SM: D4M

6uu9

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E. coli mutant sigma-S transcription initiation complex with an 8-nt RNA ("Fresh" mutant crystal soaked with GTP, UTP, CTP, and ddATP for 30 minutes)

SM: 2DA

6v9b

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Co-crystal structure of the fluorogenic Mango-IV homodimer bound to TO1-Biotin

SM: QSA QSA QSA

6v9d

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Co-crystal structure of the fluorogenic Mango-IV homodimer bound to TO1-Biotin

SM: QW4 QW4 QW4

6yl5

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Crystal structure of the SAM-SAH riboswitch with SAH

SM: SAH SAH SAH SAH SAH SAH SAH SAH SAH

6ylb

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Crystal structure of the SAM-SAH riboswitch with SAM

SM: SAM SAM SAM SAM SAM SAM SAM SAM SAM

6ymi

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Crystal structure of the SAM-SAH riboswitch with AMP.

SM: AMP AMP AMP AMP AMP AMP AMP AMP AMP CBV CBV

6ymj

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Crystal structure of the SAM-SAH riboswitch with adenosine.

SM: ADN ADN ADN ADN ADN ADN ADN ADN ADN

6ymk

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Crystal structure of the SAM-SAH riboswitch with AMP

SM: MTA MTA MTA MTA MTA MTA MTA MTA MTA

6yml

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Crystal structure of the SAM-SAH riboswitch with decarboxylated SAH

SM: AMP DSH DSH

6ymm

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Crystal structure of the SAM-SAH riboswitch with SAM from space group P312

SM: SAM SAM SAM

6ysi

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Acinetobacter baumannii ribosome-tigecycline complex - 50S subunit

SM: T1C T1C T1C

6zsa

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Human mitochondrial ribosome bound to mRNA, A-site tRNA and P-site tRNA

SM: DOL

7l0z

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Spinach variant bound to DFHBI-1T

SM: 2ZY SPM SPM SPM

7l6r

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Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer in Complex with (m7GpppA2m)pUpUpApApA (Cap-1), S-Adenosyl-L-homocysteine (SAH) and Manganese (Mn).

SM: SAH

7l6t

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Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer in Complex with (m7GpppA2m)pUpUpApApA (Cap-1), S-Adenosyl-L-homocysteine (SAH) and two Magnesium (Mg) ions.

SM: SAH